ONI和世界大战
NCIS的历史要追溯到1882年, 由海军部将军 William H. Hunt签署的第292号令成立了海军情报办公室（Office of Naval Intelligence简称ONI） 。 ONI最初的任务是收集关于外国舰船特征和武器装备、绘制外国河流或其它水体的图表, 并且收集外国家设防、工厂设备、及造船厂等信息。
由于预料到美国将参加第一次世界大战, ONI的职责扩展为包括间谍活动, 破坏活动, 并且收集信息所有以潜在方式威胁海军的敌人；并且在第二次世界大战中ONI则负责任对破坏活动的调查, 处理威胁海军的间谍活动和颠覆活动。
NIS和冷战
1950年朝鲜战争后，主要的特工都没有特权，这种状况持续到冷战时期，1966一个命名为海军调查处（Naval Investigative Service简称NIS）的组织成立了，它是一个与ONI区别组织, 并且在1969年NIS特工成为除去文职的行政人员。
70 年代初期看见了NIS驻守在USS，6个月以巩固Deployment Afloat计划，现在称之为Special Agent Afloat。在1972 年, 刚成立的防御调查处（Defense Investigative Service简称DIS）允许NIS从背景调查中抽出来，而让他们对邢事犯罪和反间谍进行调查。
1982年, NIS 被升级了到梯形编队II 状态, 有了它自己的资金预算。梯形编队II直接向海军最高长官（Chief of Naval Operations简称CNO）汇报。 那年晚些时候, NIS又承担了对处理海军的执法和保安及海军的信息和人员安全规划。
1983年10月，在轰炸贝鲁特之后两个月，NIS创立了海军威胁预警中心（Navy Antiterrorist Alert Center简称ATAC）。ATAC每天24小时的工作就是在有征兆和恐怖袭击来临之前向海军及其海军陆战队发出警报。1984年, 特工们开始在位于Georgia的联邦执法训练中心（Federal Law Enforcement Training Center简称FLETC）接受培训，这些训练项目都是为除了FBI以外其它联邦探员安排的。
1985年, Cathal L · Flynn 成为了第一任NIS的高级主管，并增加了信息和人员安全的额外责任。1986年, 海军中央判断机构(Navy Central Adjudication Facility简称DON CAF）成立并设立在该处。现在该处每天处理1.7亿的自动化记录和500000的海军部门和美国海岸警卫队的数据。
近代的NCIS历史
在1992年, Roy D·Nedrow成为如今海军犯罪调查处（Naval Criminal Investigative Service简称NCIS）的第一个主管。Nedrow对NCIS进行了改革，在美国内部设立了14个办公室，同时在全球监督了NCIS的140个办事处。1995年, NCIS加入了“冷血谋杀案”调查组。
在1997 年5月, David L. Brant由海军部长John Dalton任命为NCIS主任。1999年, NCIS和海军陆战队犯罪调查分部（Marine Corps Criminal Investigative Division简称MCCID）签署了协议备忘录，要求海军陆战队犯罪调查分部（MCCID）融入NCIS。在2000年, 国会授予NCIS特工搜查和逮捕的权利。
在恐怖主义日益膨胀的今天，经过了USS COLE也门事件和911事件后，在2002年NCIS将他们的海军威胁预警中心ATAC演变成为了多样威胁预警中心（Multiple Threat Alert Center简称MTAC）。
--转自YDY
